Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMIGD1Q6UXZ0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms