Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GDF6Q6KF10 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms