Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DUSP28Q4G0W2 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms