Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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RTL8BQ17RB0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RTL8BQ17RB0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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RTL8BQ17RB0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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RTL8BQ17RB0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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RTL8BQ17RB0 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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RTL8BQ17RB0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RTL8BQ17RB0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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