Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CTF1Q16619 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CTF1Q16619 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CTF1Q16619 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CTF1Q16619 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CTF1Q16619 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTF1Q16619 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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