Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
ZNF56Q15929 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms