Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHRNA2Q15822 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms