Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PUM3Q15397 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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PUM3Q15397 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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PUM3Q15397 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
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PUM3Q15397 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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PUM3Q15397 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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PUM3Q15397 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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PUM3Q15397 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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PUM3Q15397 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PUM3Q15397 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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