Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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IRF4Q15306 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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IRF4Q15306 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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IRF4Q15306 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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IRF4Q15306 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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IRF4Q15306 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
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IRF4Q15306 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
IRF4Q15306 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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