Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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TRAM2Q15035 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAM2Q15035 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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