Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOFQ13790 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOFQ13790 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOFQ13790 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOFQ13790 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOFQ13790 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOFQ13790 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOFQ13790 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOFQ13790 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOFQ13790 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOFQ13790 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOFQ13790 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOFQ13790 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOFQ13790 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOFQ13790 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOFQ13790 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APOFQ13790 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APOFQ13790 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOFQ13790 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOFQ13790 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOFQ13790 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOFQ13790 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOFQ13790 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOFQ13790 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOFQ13790 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOFQ13790 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOFQ13790 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOFQ13790 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
APOFQ13790 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
APOFQ13790 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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