Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NCOA4Q13772 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NCOA4Q13772 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms