Protein–RNA interactions for Protein: Q13371

PDCL, Phosducin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCLQ13371 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PDCLQ13371 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms