Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SP140Q13342 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP140Q13342 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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SP140Q13342 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP140Q13342 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SP140Q13342 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SP140Q13342 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SP140Q13342 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP140Q13342 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SP140Q13342 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SP140Q13342 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP140Q13342 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP140Q13342 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP140Q13342 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP140Q13342 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP140Q13342 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP140Q13342 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP140Q13342 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SP140Q13342 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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