Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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FOXD4Q12950 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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FOXD4Q12950 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FOXD4Q12950 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FOXD4Q12950 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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