Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRIN2AQ12879 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRIN2AQ12879 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
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