Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC15Q0P6D6 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms