Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DDR1Q08345 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms