Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DEUP1Q05D60 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms