Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRIN1Q05586 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRIN1Q05586 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms