Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 ZNF738-203ENST00000594245 1086 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 PFDN1-201ENST00000261813 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 TRIM64C-201ENST00000617704 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNB1Q02641 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 OR5AU1-201ENST00000304418 1199 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 ATP6V1B1-AS1-201ENST00000422761 1129 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC009245.1-201ENST00000456481 862 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AP001619.2-201ENST00000458654 587 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 TUBD1-206ENST00000539018 1027 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC013652.2-202ENST00000558948 910 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 ONECUT1-202ENST00000560699 996 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 SNURF-202ENST00000577949 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 SUZ12P1-207ENST00000583950 741 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 GTF2B-201ENST00000370500 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AL358913.2-201ENST00000553881 1548 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AC005550.1-201ENST00000438923 312 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB1Q02641 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms