Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLCB3Q01970 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLCB3Q01970 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms