Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms