Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKD1P98161 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKD1P98161 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKD1P98161 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKD1P98161 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKD1P98161 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKD1P98161 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PKD1P98161 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PKD1P98161 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKD1P98161 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKD1P98161 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKD1P98161 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PKD1P98161 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PKD1P98161 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PKD1P98161 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKD1P98161 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKD1P98161 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKD1P98161 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKD1P98161 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PKD1P98161 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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