Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
JAG1P78504 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JAG1P78504 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
JAG1P78504 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
JAG1P78504 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
JAG1P78504 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JAG1P78504 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JAG1P78504 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
JAG1P78504 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
JAG1P78504 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
JAG1P78504 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JAG1P78504 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
JAG1P78504 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JAG1P78504 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
JAG1P78504 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JAG1P78504 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JAG1P78504 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JAG1P78504 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JAG1P78504 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
JAG1P78504 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JAG1P78504 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JAG1P78504 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
JAG1P78504 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
JAG1P78504 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
JAG1P78504 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
JAG1P78504 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
JAG1P78504 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
JAG1P78504 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
JAG1P78504 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
JAG1P78504 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
JAG1P78504 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
JAG1P78504 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
JAG1P78504 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
JAG1P78504 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
JAG1P78504 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
JAG1P78504 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
JAG1P78504 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
JAG1P78504 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
JAG1P78504 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
JAG1P78504 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
JAG1P78504 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
JAG1P78504 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
JAG1P78504 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
JAG1P78504 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
JAG1P78504 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
JAG1P78504 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
JAG1P78504 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
JAG1P78504 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
JAG1P78504 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
JAG1P78504 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
JAG1P78504 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
JAG1P78504 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
JAG1P78504 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
JAG1P78504 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
JAG1P78504 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
JAG1P78504 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JAG1P78504 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JAG1P78504 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JAG1P78504 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JAG1P78504 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JAG1P78504 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JAG1P78504 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JAG1P78504 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JAG1P78504 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JAG1P78504 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JAG1P78504 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JAG1P78504 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JAG1P78504 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
JAG1P78504 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
JAG1P78504 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JAG1P78504 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JAG1P78504 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JAG1P78504 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
JAG1P78504 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JAG1P78504 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
JAG1P78504 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
JAG1P78504 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JAG1P78504 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JAG1P78504 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JAG1P78504 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JAG1P78504 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JAG1P78504 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
JAG1P78504 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
JAG1P78504 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
JAG1P78504 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
JAG1P78504 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
JAG1P78504 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
JAG1P78504 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
JAG1P78504 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
JAG1P78504 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
JAG1P78504 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
JAG1P78504 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
JAG1P78504 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
JAG1P78504 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
JAG1P78504 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
JAG1P78504 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
JAG1P78504 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
JAG1P78504 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
JAG1P78504 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
JAG1P78504 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms