Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCBP4P57723 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms