Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms