Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC13P55735 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC13P55735 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC13P55735 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC13P55735 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC13P55735 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC13P55735 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC13P55735 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC13P55735 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC13P55735 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC13P55735 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC13P55735 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC13P55735 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC13P55735 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC13P55735 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC13P55735 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC13P55735 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC13P55735 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC13P55735 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC13P55735 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC13P55735 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC13P55735 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC13P55735 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC13P55735 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC13P55735 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC13P55735 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC13P55735 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC13P55735 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC13P55735 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC13P55735 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC13P55735 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEC13P55735 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC13P55735 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC13P55735 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC13P55735 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC13P55735 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC13P55735 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC13P55735 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC13P55735 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC13P55735 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC13P55735 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEC13P55735 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEC13P55735 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC13P55735 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC13P55735 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC13P55735 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC13P55735 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC13P55735 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC13P55735 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEC13P55735 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms