Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
POLR2KP53803 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
POLR2KP53803 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms