Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GCLMP48507 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GCLMP48507 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCLMP48507 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCLMP48507 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCLMP48507 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCLMP48507 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCLMP48507 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCLMP48507 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCLMP48507 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCLMP48507 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCLMP48507 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCLMP48507 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCLMP48507 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCLMP48507 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCLMP48507 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCLMP48507 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCLMP48507 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCLMP48507 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCLMP48507 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCLMP48507 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCLMP48507 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCLMP48507 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCLMP48507 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCLMP48507 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GCLMP48507 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCLMP48507 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCLMP48507 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCLMP48507 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCLMP48507 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCLMP48507 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCLMP48507 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCLMP48507 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCLMP48507 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCLMP48507 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GCLMP48507 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCLMP48507 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCLMP48507 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
GCLMP48507 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCLMP48507 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCLMP48507 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCLMP48507 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCLMP48507 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GCLMP48507 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GCLMP48507 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms