Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARCN1P48444 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms