Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV4P43268 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV4P43268 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV4P43268 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV4P43268 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV4P43268 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV4P43268 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV4P43268 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV4P43268 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV4P43268 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV4P43268 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV4P43268 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV4P43268 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV4P43268 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV4P43268 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV4P43268 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV4P43268 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ETV4P43268 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV4P43268 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV4P43268 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV4P43268 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV4P43268 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV4P43268 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV4P43268 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV4P43268 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV4P43268 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV4P43268 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV4P43268 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV4P43268 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV4P43268 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV4P43268 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV4P43268 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV4P43268 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV4P43268 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV4P43268 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV4P43268 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV4P43268 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV4P43268 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV4P43268 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV4P43268 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV4P43268 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV4P43268 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV4P43268 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV4P43268 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV4P43268 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ETV4P43268 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ETV4P43268 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV4P43268 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV4P43268 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV4P43268 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV4P43268 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV4P43268 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV4P43268 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV4P43268 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV4P43268 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ETV4P43268 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms