Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LMO2P25791 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LMO2P25791 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LMO2P25791 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms