Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTPREP23469 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPREP23469 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPREP23469 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPREP23469 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPREP23469 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPREP23469 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPREP23469 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPREP23469 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPREP23469 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPREP23469 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPREP23469 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPREP23469 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPREP23469 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPREP23469 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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PTPREP23469 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPREP23469 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPREP23469 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPREP23469 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPREP23469 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPREP23469 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPREP23469 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPREP23469 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPREP23469 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPREP23469 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPREP23469 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPREP23469 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPREP23469 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPREP23469 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPREP23469 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PTPREP23469 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PTPREP23469 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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