Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CXCL2P19875 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms