Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PDE6GP18545 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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