Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF888P0CJ79 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF888P0CJ79 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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