Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC172P0C7W6 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC172P0C7W6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms