Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TYMSP04818 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
TYMSP04818 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms