Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SERPINC1P01008 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SERPINC1P01008 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms