Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX7O95931 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX7O95931 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX7O95931 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX7O95931 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX7O95931 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX7O95931 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX7O95931 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CBX7O95931 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CBX7O95931 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CBX7O95931 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CBX7O95931 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms