Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX3O95343 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX3O95343 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX3O95343 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX3O95343 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX3O95343 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX3O95343 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX3O95343 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX3O95343 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX3O95343 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX3O95343 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX3O95343 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX3O95343 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX3O95343 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX3O95343 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX3O95343 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX3O95343 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX3O95343 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX3O95343 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX3O95343 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX3O95343 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX3O95343 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX3O95343 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX3O95343 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX3O95343 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX3O95343 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX3O95343 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX3O95343 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX3O95343 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX3O95343 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SIX3O95343 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SIX3O95343 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX3O95343 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX3O95343 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX3O95343 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX3O95343 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX3O95343 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX3O95343 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX3O95343 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX3O95343 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX3O95343 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX3O95343 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX3O95343 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX3O95343 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX3O95343 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX3O95343 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX3O95343 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX3O95343 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX3O95343 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX3O95343 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX3O95343 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX3O95343 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX3O95343 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX3O95343 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX3O95343 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX3O95343 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SIX3O95343 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms