Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF4O60810 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF4O60810 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms