Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DENRO43583 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DENRO43583 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DENRO43583 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms