Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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MTSS1O43312 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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MTSS1O43312 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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MTSS1O43312 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTSS1O43312 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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