Protein–RNA interactions for Protein: O43281

EFS, Embryonal Fyn-associated substrate, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFSO43281 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFSO43281 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFSO43281 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFSO43281 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
EFSO43281 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFSO43281 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
EFSO43281 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EFSO43281 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EFSO43281 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFSO43281 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFSO43281 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFSO43281 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFSO43281 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EFSO43281 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms