Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CLDN25C9JDP6 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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