Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CHTOPQ9Y3Y2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms