Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HPS5Q9UPZ3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms