Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ZNRF3Q9ULT6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms